Hösten är den underskattade säsongen. Trafiken har dragit sig tillbaka efter augusti, vädret är ofta stabilt och färgerna i lövskogen — speciellt på öar med björk och asp — är spektakulära. September är ofta en av årets vackraste månader i Stockholms skärgård.
Vattnet är fortfarande varmt från sommaren (15–18 °C i september) men svalnar snabbt. Restauranger och boende börjar stänga successivt under september–oktober. I november är det mest helår-verksamheter kvar.
Höst är perfekt för dem som söker en lugn skärgårdsupplevelse med samma vackra natur som på sommaren, men utan trängsel. Svampplockning, vandring och kajakpaddling i stilla vatten är säsongens höjdpunkter.